NCBI C++ Toolkit

সফটওয়্যার স্ক্রিনশট:
NCBI C++ Toolkit
সফটওয়্যার বিবরণ:
সংস্করণ: 9.0.0
তারিখ আপলোড: 20 Feb 15
ডেভেলপার: NCBI C++ Toolkit Development Team
লাইসেন্স: বিনামূল্যে
জনপ্রিয়তা: 31

Rating: nan/5 (Total Votes: 0)

কোন সীমাবদ্ধতা ব্যবহার সঙ্গে

NCBI সি ++ টুলকিট বিনামূল্যে, পোর্টেবল, পাবলিক ডোমেইন লাইব্রেরি উপলব্ধ করা হয়. এটা ইউনিক্স, মাইক্রোসফট উইন্ডোজ, এবং ম্যাক অপারেটিং সিস্টেম প্ল্যাটফর্ম কাজ:
ย ท iostream অ্যাডাপ্টার সঙ্গে নেটওয়ার্কিং এবং Interprocess কমিউনিকেশন (IPC) লাইব্রেরি
ย ท multithreading লাইব্রেরী
ย ท সিজিআই এবং দ্রুত সিজিআই লাইব্রেরী
ย ท এইচটিএমএল জেনারেশন লাইব্রেরী
ย ท SQL ডাটাবেস অ্যাক্সেস লাইব্রেরী
BerkeleyDB জন্য ย ท সি ++ আলোয়ান লাইব্রেরি
ย ท সি ++ iostream অ্যাডাপ্টারের / আবরণ লাইব্রেরী
Iostream অ্যাডাপ্টারের সাথে ย ท GZIP এবং পড়া bz2 সি ++ আবরণ লাইব্রেরী
ย ท ASN.1 এবং সি ++ কোড জেনারেটরের টুল সঙ্গে XML Serialization গ্রন্থাগার (datatool)
ย ท তারিখ এবং সময় লাইব্রেরী
ย ท ফাইল সিস্টেম ফাংশন লাইব্রেরী
ย ท কমান্ড লাইন আর্গুমেন্ট, কনফিগারেশন এবং পরিবেশ প্রসেসিং লাইব্রেরী
ย ท সিকোয়েন্স সারিবদ্ধতা গাণিতিক পরিভাষা লাইব্রেরী
ย ท ব্লাস্ট ইঞ্জিন লাইব্রেরী
ย ท জৈব ক্রম আহরণ ও প্রক্রিয়াকরণ লাইব্রেরী
ย ท পোর্টেবল FLTK এবং OpenGL ভিত্তি করে গ্রাফিক্যাল ইউজার ইন্টারফেস এবং গ্রাফিক লাইব্রেরি
উপরে এছাড়া, একটি সম্পূর্ণ অনেক বেশী দরকারী লাইব্রেরি, উভয় সাধারণ উদ্দেশ্য এবং বায়োটেক সংক্রান্ত ক্রমাগত উন্নত বজায় রাখা এবং ওয়েব এবং স্বতন্ত্র অ্যাপ্লিকেশন এবং তাদের প্রোগ্রামারদের শত শত দ্বারা বাস্তব জীবনের উৎপাদন ব্যবহার করা হয় যে (এছাড়াও শত শত গণনা) আছে.
আপনি একটি সি ++ ডেভেলপার হন, তাহলে আপনি বায়োইনফরমেটিক্স অনেক আগ্রহ আছে না, এমনকি যদি আপনি ক্রস প্ল্যাটফর্ম অ্যাপ্লিকেশন নির্মাণ খুব দরকারী লাইব্রেরি পোর্টেবল প্রকৃতি খুঁজে পেতে হবে. যেমন সিজিআই / ফাস্ট-সিজিআই, এইচটিএমএল, নেটওয়ার্কিং, SQL ডাটাবেস অ্যাক্সেস, ASN.1 এবং XML Serialization জন্য বেশী হিসাবে গ্রন্থাগার বেশ সাধারণ উদ্দেশ্য এবং বায়োইনফর্মেটিকস সমস্যা ডোমেইন বাইরে অ্যাপ্লিকেশনের বিভিন্ন ব্যবহার করা যেতে পারে.
লাইব্রেরি প্রতি রাতে নির্মিত হচ্ছে সঙ্গে সি ++ টুলকিট সক্রিয় উন্নয়ন ক্ষয়ের. সোর্স কোড FTP ও জীবনবৃত্তান্ত মাধ্যমে অবাধে পাওয়া যায়. সি ++ টুলকিট ডকুমেন্টেশন অ্যাক্রোব্যাট এর পিডিএফ ফরম্যাটে হিসাবে ডাউনলোড বই এছাড়াও NCBI বইয়ের থাকটি বিন্যাসে উপলব্ধ অনলাইন এবং

এই রিলিজে নতুন কি:.

< p>
  • দিগ:
  • SQLite3 উপর ভিত্তি করে যা যোগ করা হয়েছে LDS2 (স্থানীয় তথ্য সংগ্রহের v.2) নতুন বৈশিষ্ট্য এবং উন্নত কর্মক্ষমতা আছে. এছাড়াও অবজেক্ট ম্যানেজার থেকে LDS2 ব্যবহার করতে LDS2 তথ্য-লোডার প্রয়োগ করা.
  • XmlWrapp সুবিধাজনক এক্সএমএল হ্যান্ডলিং এপিআই বেশিরভাগ সমাপ্ত (এবং এমনকি পালিশ) হয়েছে -এই.
  • HTTP প্রক্সি মাধ্যমে টানেলিং ও HTTP সংযোগ এবং নিরাপদ সকেট টানেলিং এর অনুমোদন, বাস্তবায়িত.
  • CFormatGuess এখন GTF, GFF3, এবং GFF2 মধ্যে পার্থক্য করতে পারবেন. এটি একটি সম্ভবত ভঙ্গ পরিবর্তন. আরো বিস্তারিত নিচে দেখুন.
  • CFeatTree এর বাস্তবায়িত প্রধান অংশ, তাদের পিতা বা মাতা-সন্তানের সম্পর্ক প্রতিফলিত করে যে একটি অনুক্রমের মধ্যে একটি জৈব ক্রম উপর নির্ধারিত বৈশিষ্ট্য সংগঠিত বর্গ (বৈশিষ্ট্য উপশাখাকে উপর ভিত্তি করে).
  • CORELIB:
  • স্ট্রিং এর বাস্তবায়িত লোকেল-স্বাধীন রূপান্তর দুবার এবং ব্যাক করা; পরিবর্তিত কোর লাইব্রেরি এটি ব্যবহার করার জন্য.
  • NStr ::) (জাস্টিফাই - টেক্সট অনুচ্ছেদ বিন্যাসকরণ জন্য
  • .
  • CNcbiApplication - FindProgramExecutablePath স্ট্যাটিক, এবং আরো জোরালো করা; একটি স্ট্যাটিক উচ্চ স্তরের GetAppName পদ্ধতি যোগ করুন. আরো ক্ষেত্রে বিশ্বব্যাপী কনফিগারেশন ফাইল ভাগ্যের.
  • CMetaRegistry :: FindRegistry -. নতুন পদ্ধতি লোড ফাইল (যদি থাকে) তা নির্ধারণের যুক্তি প্রকাশক
  • CEnvironmentCleaner -. অবাঞ্ছিত এনভায়রনমেন্ট ভেরিয়েবল বাতিল করতে নতুন বর্গ
  • CFileIO - মূল আচরণ ফিরে. এটা SetFileHandle () এর মাধ্যমে নির্ধারিত হলে ফাইল হ্যান্ডেল বন্ধ না
  • সিরিয়াল:
  • AnyContent তথ্য বস্তু এর serialization - চিনতে সংশোধন করা হয়েছে এবং সঠিকভাবে প্রক্রিয়া তাদের মান বৈশিষ্ট্যাবলী করুন
  • .
  • এটি কোন কন্টেন্ট আছে যখন একটি উপাদান ডিফল্ট মান দায়িত্ব অর্পণ করা XML তথ্য পড়ার সংশোধন.

  • উপাদান একটি ডিফল্ট মান আছে যেখানে উপাদান, ক্রমের জন্য
  • সমর্থন যোগ করা হয়েছে.
  • DATATOOL:
  • সংশোধন কোড প্রজন্মের:
  • পছন্দ তথ্য বস্তু;

  • গুণাবলী সঙ্গে
  • বাইনারি ধরনের তথ্য.
  • ডবল মান সংশোধন রূপান্তর আরো উল্লেখযোগ্য সংখ্যা সংরক্ষণ করা.
  • সংযোগ:
  • যোগ করা হয়েছে আমার KeepAlive সকেট বিকল্প (fSOCK_KeepAlive).
  • যোগ করা হয়েছে NCBI সংযোগ পরীক্ষা (CConnTest).
  • utilites:
  • g_FindDataFile -. (কনফিগার) মান স্থানে ডাটা ফাইল লোকেটিং জন্য নতুন ফাংশন
  • CChecksumStreamWriter -. একটি প্রবাহ লেখা তথ্য যোগফল গণনা নতুন ক্লাস
  • g_GZip_ScanForChunks () - নতুন এপিআই, কম্প্রেস প্রবাহ অবস্থানের প্রশ্ন করতে. সংযুক্ত gzip, ফাইলের ভিতরে পৃথক gzip, ফাইল জন্য অবস্থানের পাওয়ার জন্য বাস্তবায়ন যোগ করা হয়েছে.
  • যোগ করা হয়েছে কম্প্রেশন / ডিকম্প্রেশন প্রবাহ manipulators (/ util / কম্প্রেস / stream_util.hpp অন্তর্ভুক্ত).
  • CFormatGuess (util / format_guess. {হা / গ} পিপি) একটি সম্ভবত ভঙ্গ পরিবর্তনের সঙ্গে, আপডেট করা হয়েছে. এই উদ্দেশ্য CFormatGuess GTF, GFF3, এবং GFF2 মধ্যে পার্থক্য করার অনুমতি দেয় না. বর্তমানে এটি একটি এক 'eGtf' মান মধ্যে যারা ফরম্যাটের সব ফোলা বা ডেলা বাধঁা. পুরানো 'eGtf' মান (3) 'eGtf_POISONED' দিয়ে প্রতিস্থাপিত করা হচ্ছে, এবং আবার ফিরে হবে না. 'eGtf' (21) জন্য নতুন মান CGtfReader (objtools / পাঠকদের / gtf_reader.hpp) সঙ্গে পড়তে হবে যে একটি ফাইল অর্থ হবে. নতুন মান 'eGff3' (22) ফাইল ফাইল জন্য CGff2Reader সঙ্গে পড়তে হবে বোঝানো CGff3Reader (objtools / পাঠকদের / gff3_reader.hpp), এবং 'eGff2' (24) সঙ্গে পড়তে হবে বোঝানো হয় (/ objtools / পাঠকদের অন্তর্ভুক্ত /gff2_reader.hpp)
  • জৈব-বস্তু:
  • CBioseq :: GetNonLocalId - আরো প্রেক্ষাপটে পরিসীমা উল্লেখ FASTA ফাইল থেকে আমদানি জায়গা ক্রম সাহায্য করার জন্য নতুন পদ্ধতি; CBioseq_Handle :: GetNonLocalIdOrNull (অনুরূপভাবে নতুন) দ্বারা আবৃত.
  • CSeq_id :: IdentifyAccession - বাস্তবায়ন বা DDBJ নতুন সম্ভাবনা মিলা যা কিছু আরো উপসর্গ (GA,, এইচ: HI, হো-হু, হ্যাঁ-জে, EAAA-EZZZ, এবং IAA-Izz জন্য স্বীকৃতি উন্নত TPA WGS তথ্য) এবং বেশিরভাগ EMBL থেকে মিশ্র-এ TPA প্রোটিন accessions (, কিন্তু খুব length-থেকে কিছু).
  • নতুন পতাকা বিট দ্বারা WGS মাস্টার accessions পার্থক্য. ওভার কঠোর পিডিবি স্বীকৃতি যুক্তি আরাম.
  • CSeq_id :: IsValidLocalID, CSeq_id :: ParseIDs -. প্লেইন টেক্সট ক্রম অভিন্ন পরিচয় সঙ্গে কাজ করার জন্য নতুন কার্যকারিতা, CFastaReader আউট করেছিল এবং কিছুটা সাধারণ করুন

  • কিছু FASTA defline উৎস মোডিফায়ার মধ্যে, SEQ-আইডি রেঞ্জ সঙ্গে হিসেবে উপস্থিত কাজ করার জন্য (; iterator, & quot পার্সার এবং-মাছি, & quot সম্পূর্ণ) নতুন টাইপ -
  • SSeqIdRange.
  • জৈব-সরঞ্জাম:
  • CFastaOstream - বিকল্প একক ক্রমের জন্য কাস্টম শিরোনাম গ্রহণ. নেতৃস্থানীয় 'গ এর সঙ্গে ট্যাগ নেতিবাচক-তীরভূমি রেঞ্জ.

  • .
  • CFastaReader - নেতিবাচক-তীরভূমি রেঞ্জ এবং প্রাচীন ভেনিসীয় স্বর্ণমুদ্রা এর কম্প্যাক্ট defline-শৈলী ফাঁক সিনট্যাক্স সমর্থন (?, & Quot; & gt; এন একটি সংখ্যা যেখানে; এন, & quot অথবা & quot; & gt; unk100 & quot;)
  • কোবল্ট:

  • প্রান্তিককরণ সীমাবদ্ধতার কম্পিউটিং ব্যবহৃত অনুক্রম প্রতি সংরক্ষিত ডোমেইন সংখ্যা সীমিত যে
  • যোগ করা হয়েছে কমান্ড-লাইন বিকল্প -num_domain_hits.
  • ফাইলোজেনেটিক গাছ:
  • (যেমন ব্লাস্ট এবং কোবল্ট ফলাফলের জন্য) ক্রম alignments থেকে ফাইলোজেনেটিক গাছ কম্পিউটিং জন্য উচ্চ স্তরের ইন্টারফেস যোগ করা হয়েছে. ক্লাস CPhyTreeCalc ফাইলোজেনেটিক গাছ নির্ণয় করে, এবং CPhyTreeFormater Newick এবং নেক্সাস বিন্যাসে গাছ ছাপে.
  • জৈব-লক্ষ্য লাইব্রেরি:
  • বাস্তবায়িত CheckNumRows () এবং বিক্ষিপ্ত alignments জন্য অন্যান্য পদ্ধতি.
  • মেমরি পদাঙ্ক কমাতে: deserialization পর alignments দ্বারা ব্যবহৃত মেমরি কমাতে পড়া-আঙ্গুলসমূহ যোগ করা; Na-তীরভূমি এখন মেমরি যেখানে সম্ভব এক বাইট ব্যবহার করে; Score.value পছন্দ এখন CScore এমবেড করা হয়.
  • (CSeq_id :: GetLabel মধ্যে সংযোজন পুঁজিতে).
  • জৈব-বস্তুর পরিচালক:

  • CTableFieldHandle মধ্যে বুলিয়ান ক্ষেত্রের জন্য
  • যোগ করা হয়েছে লোক পদ্ধতি.

  • CFeatTree উপর ভিত্তি করে
  • যোগ করা হয়েছে GetBestGeneForFeat ().
  • CFeatTree উপর GetBestOverlappingFeat (). বাস্তবায়িত
  • যোগ করা হয়েছে দ্রুত CScope :: GetTaxid ().
  • দুদকের / Ver, সিপাহী, লেবেল, এবং taxid জন্য বাস্তবায়িত বাল্ক লোড হচ্ছে.
  • যোগ করা হয়েছে শূন্য দৈর্ঘ্যের ফাঁক CSeqMap এবং CSeqVector পরীক্ষা করুন.
  • বাস্তবায়িত GetLength () এবং বন্ড অবস্থানের জন্য GetCoverage ().
  • উন্নতি:
  • যোগ করা হয়েছে সাহায্যকারী পদ্ধতি অবস্থান CFeatTree পূরণ করুন.
  • CFeat_CI সহজ CSeq_loc_mix অবস্থানের ম্যাপিং আপ sped.

  • বিভ্রান্তি এড়ানোর জন্য CFeat_CI বৈশিষ্ট্য
  • সুনির্দিষ্ট শ্রেণীবিভাজন.
  • এখন SEQ-টেবিল সঙ্গে কাজ CSeq_feat_Handle getters খুব বৈশিষ্ট্য.
  • SEQ-টেবিল বৈশিষ্ট্য এখন মাল্টি লেভেল ব্যবহারকারী ক্ষেত্র সমর্থন করে.

  • বিভক্ত খণ্ড যদি অবস্থিত
  • অ SEQ-কৃতিত্ব SEQ-টেবিল এখন আরও স্বীকৃত হয়.
  • CBioseq_Handle :: AddId আপ sped ().
  • অনুকূল CScope :: AttachXxx ().

  • নামে টীকা এর
  • সমর্থন বিভক্ত.
  • CSeqVector এবং CSeqVector_CI এর CanGetRange () এখন মিথ্যা পরিবর্তে একটি ব্যতিক্রম নিক্ষেপ ফিরে.
  • ) (ResetHistory মধ্যে বিদ্যমান হ্যান্ডলগুলি সঙ্গে মোকাবেলা কিভাবে নির্দিষ্ট করার অনুমতি দিন.
  • আরও বৈশিষ্ট্য CFeatTree যোগ করা হয়, তাহলে পুনরায় মা অনুকূল.
  • CScope নির্মাণ / অপসারণ ডিবাগ করার সম্ভাবনা যোগ করা হয়েছে.
  • ইতিমধ্যেই আছে BasicCleanup সঙ্গে কাজ করতে হবে আরো কাজ এখনও, কিন্তু উল্লেখযোগ্য অগ্রগতি হয়েছে সি বিদ্যমান যা পরিষ্করণ কার্যকারিতা নকল করা সি ++ পরিষ্করণ কার্যকারিতা অনেক পরিবর্তন. একটু কাজ এখনো হিসাবে ExtendedCleanup জন্য করা হয়েছে.
  • CSeq_loc_Mapper এখন একটি জিসি-পরিষদের সঙ্গে সক্রিয়া করা যেতে পারে.
  • বাগ সংশোধন করা হয়েছে:
  • CFeat_CI বিয়োগ সূত্র উপর মিশ্রণ অবস্থানে স্থায়ী ম্যাপিং.
  • CFeatTree বৈশিষ্ট্য সংযোগ ভাবে অনেক সংশোধন করা হয়েছে.
  • বেশ কিছু থ্রেড-নিরাপত্তা সংশোধন করা হয়েছে.

  • CSeq_annot_EditHandle সাজায় এবং গ্রাফ যোগ বাধা
  • টাইপো সংশোধন করা হয়েছে.
  • ব্যতিক্রম বিরুদ্ধে রক্ষাকবচ CFeat_CI বৈশিষ্ট্য বাছাই করার সময়.
  • length-তথ্য-লোডার:
  • নিবন্ধিত HPRD বহিরাগত টীকা.
  • pubseqos / pubseqos2 পাঠকদের ঐচ্ছিক exclude_wgs_master পরম যোগ করা হয়েছে.
  • দুদকের / Ver, সিপাহী, লেবেল, এবং taxid জন্য বাস্তবায়িত বাল্ক লোড হচ্ছে.
  • যোগ করা হয়েছে CGBDataLoader :: CloseCache ().
  • উন্নয়ন:

  • CScope :: GetBioseqHandles মধ্যে
  • ব্যবহার বাল্ক লোড হচ্ছে অনুরোধ ().
  • লোড ব্লব টাইপ দ্বারা পৃথক পাঠক পরিসংখ্যান.
  • length-ডিবাগ বার্তা যোগ করা হয়েছে টাইমস্ট্যাম্প.

  • PubSeqOS সংযোগ খোলার জন্য
  • ব্যবহার IConnValidator.
  • ভুল অংশ ব্যবহার এড়াতে length-ক্যাশের মধ্যে খণ্ড খণ্ড অনুরোধ এবং subkeys যোগ করা হয়েছে বিভক্ত-সংস্করণ ফোঁটা বিভক্ত রাষ্ট্র আইডি পরিবর্তন করা হয়.

  • খোলা সময়সীমার জন্য
  • যোগ করা হয়েছে মাধ্যমিক কম বিভ্রান্তিকর পরম নাম.
  • সংযোগ সংখ্যা দ্বারা গণনা পুনরায় চেষ্টা সংখ্যাবৃদ্ধি না.
  • বস্তুর পরিচালক এবং পরীক্ষা ডেমো অ্যাপ্লিকেশন:
  • id2_fetch_simple -. অবাধ SEQ-আইডি এর জন্য যোগ করা হয়েছে -ið বিকল্প
  • test_bulkinfo -. নতুন পরীক্ষা আবেদন করুন
  • FASTA:
  • সি ++ বৈশিষ্ট্য টেবিল কার্যকারিতা যেমন BankIt প্রকল্পের অংশ হিসাবে আরো কার্যকরী করা হয়েছে.
  • ইউটিলিটি asn2flat

  • (কিছু তুলনামূলকভাবে গৌণ বিষয় থাকা, যদিও সম্ভবত এই সময়ে প্রস্তুত মুক্তি)
  • Flatfile ফরম্যাটকারী পরিবর্তন বিপুল সংখ্যা এটি অনেক বেশী ঘনিষ্ঠ মুক্তি প্রস্তুত রাষ্ট্র আনা.
  • XMLWRAPP:
  • XPath রাশি ফলাফল চলমান একটি রেফারেন্স গ্রহণ ক্ষেত্রে সংশোধন করা হয়েছে সেগমেন্টেশন ফল্ট.
  • বহিরাগত এবং অভ্যন্তরীণ সাব জন্য পাবলিক আইডি, সিস্টেম আইডি এবং নথি প্রকার সংজ্ঞা নাম পেতে সাহায্যকারী যোগ করা হয়েছে.
  • যোগ করা হয়েছে পদ্ধতি নোড বৈশিষ্ট্যাবলী লুকআপ.
  • XPath রাশি স্থায়ী মৃত্যুদন্ড. এটা এখন দেওয়া নোড থেকে শুরু হয়
  • নামস্থান প্রদান করা হয় যখন (ডিফল্ট সহ) বৈশিষ্ট্যাবলী অনুসন্ধান সংশোধন করা হয়েছে.
  • স্পষ্টভাবে নামব্যবধান রেজিস্টার প্রয়োজন ছাড়া XPath রাশি চালানোর ক্ষমতা যোগ করা হয়েছে.
  • নথি পার্স করার সময় ত্রুটি এবং সতর্কবার্তা সংগ্রহের জন্য পাত্রে প্রদান ক্ষমতা যোগ করা হয়েছে.
  • নোড এর ডিফল্ট বৈশিষ্ট্যাবলী মান এবং নামব্যবধান পরিবর্তন করতে ক্ষমতা যুক্ত.
  • যোগ করা হয়েছে একটি বৈশিষ্ট্য ডিফল্ট যদি পরীক্ষা করতে সক্ষম.
  • যোগ করা হয়েছে একাউন্টে তাদের নামব্যবধান গ্রহণ করার সময় সন্নিবেশ বা গুণাবলী অপসারণ করার ক্ষমতা.
  • ডকুমেন্ট সেভ করা হয় যখন এক্সএমএল ঘোষণার স্ট্রিপ ক্ষমতা যোগ করা হয়েছে.
  • WindowMasker:
  • নতুন ইনপুট বিন্যাস & quot যোগ করা হয়েছে; seqids, & quot ;; এই ইনপুট বিন্যাস সঙ্গে, ইনপুট প্রতিটি লাইন একটি ক্রম আইডি ধারণকারী একটি ফাইল, এবং আলগোরিদিম ক্রম সন্ধান বায়ো-অবজেক্ট ম্যানেজার ব্যবহার করে.
  • সব WindowMasker কনফিগারেশন পরামিতি জমা করার জন্য, একটি নতুন বর্গ CWinMaskConfig যোগ করা হয়েছে. বর্গ কমান্ড লাইন আর্গুমেন্ট থেকে কনফিগারেশন পরামিতি CArgDescriptions প্রয়োজন কমান্ড লাইন আর্গুমেন্ট যোগ করুন, এবং তারপর পেতে ব্যবহার করা যেতে পারে.
  • বিল্ড ফ্রেমওয়ার্ক (ইউনিক্স):
  • সেখানে দেওয়া না অন্যান্য * _PROJ সেটিংস পরিষ্কার আউট থেকে একটি সূত্র APP_PROJ বা LIB_PROJ কমান্ড-লাইন উল্লেখ ব্যাখ্যা করা. (গনুহ করুন প্রয়োজন;. সূর্য দিয়ে তৈরী করে যেমন আগে কাজ চালিয়ে করুন)

  • সাব-ডিরেক্টরি মধ্যে
  • সরবরাহ আরো লক্ষ্যমাত্রা: *. _f (উপরের স্তরের Makefile.flat মোড়কে), * _fd (চাহিদা উত্পাদিত স্থানীয় ফ্ল্যাট ফাইল তৈরী, গাছ অন্যান্য অংশের উপর উপেক্ষা নির্ভরতা ব্যবহার করে), clean_sources এবং purge_sources করুন
  • কনফিগার করুন এবং তার সুবিধার্থে স্ক্রিপ্ট (কম্পাইলার / ইউনিক্স / * SH.):

  • --without-3psw
  • উল্লেখযোগ্য নতুন পতাকা. - না কোন 3 য় পক্ষের ডিভাইসের সঙ্গে ব্যবহার করুন
  • GLEW জন্য একটি চেক যোগ করা হয়েছে.

  • বুস্ট এবং OpenGL জন্য
  • উন্নত চেক.
  • আধুনিক toolchains সিস্টেমের ডারউইন (ম্যাক) উপর রান পাথ উল্লেখ সমর্থন.
  • বিস্ফোরণে:

  • ডারউইন (Mac OS X এর) উপর
  • , অন্যথায় সর্বজনীন কারণে একটি পাওয়ারপিসি টুলচেইন সীমাবদ্ধতা তৈরী করে এমনকি ইন্টেল প্রসেসরের জন্য শুধুমাত্র নির্মাণ করা.

  • NCBI শ্রেণীবিন্যাস ID- র জন্য যা WindowMasker সমর্থন উপলব্ধ করা হয় প্রাপ্ত করার জন্য
  • সমর্থন যোগ করা হয়েছে.
  • psiblast একাধিক ক্রম প্রান্তিককরণ ফাইল সহ একটি প্রশ্ন ক্রম স্পেসিফিকেশন অনুমতি দিন.
  • যোগ করা হয়েছে ডাটাবেস হার্ড-মাস্কিং সমর্থন.
  • যোগ করা হয়েছে ডাটাবেস অনুবাদ অনুসন্ধানের জন্য নরম-মাস্কিং.
  • ট্যাবুলার প্রতিবেদনে btop (ব্লাস্ট ট্রেস-ব্যাক সহ অপারেশন) এবং প্রশ্নের সাথে এবং বিষয় দ্বারা জন্য সমর্থন যোগ করা হয়েছে.
  • কমান্ড-লাইন অ্যাপ্লিকেশন -, psiblast একাধিক প্রশ্নের অনুসন্ধান করার অনুমতি makeblastdb জন্য ঐচ্ছিক -input_type যোগ করুন
  • blast2sequences মোডে সেরা হিট এবং XML ব্যবহারের অনুমতি.

  • দূরবর্তী অনুসন্ধানের জন্য
  • উন্নত বিন্যাস কর্মক্ষমতা.
  • makembindex এখন ব্লাস্ট ডাটাবেসের মধ্যে সংরক্ষণ করা মাস্কিং তথ্য ব্যবহার করে একটি বিস্ফোরণ নিউক্লিওটাইড ডাটাবেস থেকে সরাসরি মাস্ক MegaBLAST সূচক নির্মাণ করতে পারেন. এই makembindex নতুন কমান্ড-লাইন বিকল্প -db_mask দ্বারা সম্পন্ন হয়. বিকল্প ব্লাস্ট ডাটাবেসের দ্বারা সমর্থিত ফিল্টারিং এলগরিদম পূর্ণসংখ্যা আইডি গ্রহণ করে. বিকল্প শুধুমাত্র -iformat blastdb সাথে প্রয়োগ করা যেতে পারে.

  • একটি প্রবল বাত্যা ডাটাবেসের দ্বারা সমর্থিত ফিল্টারিং আলগোরিদিম সাংখ্যিক আইডি দুঃশ্চিন্তা একটি ব্যবহারকারী সহায়তা
  • , পতাকা -show_filters চালু করা হয়. একটি ইনপুট আউটপুট makembindex উপলব্ধ ফিল্টারিং আলগোরিদিম এবং প্রস্থান একটি তালিকা কারণ হিসেবে -iformat blastdb এবং বিস্ফোরণে ডাটাবেসের সঙ্গে পতাকা প্রয়োগ করার পদ্ধতি.
  • অ্যাপ্লিকেশন NETCACHE:
  • NetCache নিম্নলিখিত বৈশিষ্ট্য অন্তর্ভুক্ত করা reworked হয়:
  • ডিস্কের স্থান ভাল ব্যবস্থাপনা;
  • ব্লব সঙ্গে লক কম কাজ, ভার্সন পরিবর্তে ব্যবহার করা হয়;
  • মাল্টি-পোর্ট শোনা এবং প্রতি ক্লায়েন্ট সেটিংস পার্থক্যকারী.
  • NetCache এবং ICache API গুলি:
  • ব্যবহার Uint8 সর্বত্র ফোঁটা আকার জন্য.
  • আংশিক ফোঁটা আহরণ অনুমতি দিন.
  • চালু ফোঁটা পাসওয়ার্ড সুরক্ষা; খালি পাসওয়ার্ড কোন পাসওয়ার্ড হিসাবে গণ্য করা হয়.
  • কর্মী নোড API গুলি:
  • তার মেমরি খরচ নির্দিষ্ট সীমা অতিক্রম করে কর্মী নোড সসীম জন্য নতুন পরামিতি (পরামিতি, & quot; total_memory_limit & quot;)
  • .
  • তার চালানোর সময় নির্দিষ্ট সীমা অতিক্রম করে কর্মী নোড সসীম জন্য নতুন পরামিতি (পরামিতি, & quot; total_time_limit & quot;)
  • .
  • গ্রিড অ্যাপ্লিকেশন:
  • netscheduled
  • কিউ মুছে ফেলার কমান্ড কোন উত্তর সৃষ্টিকারী একটি বাগ সংশোধন করা হয়েছে.
  • remote_app
  • নতুন কনফিগারেশন পরামিতি (& quot; tmp_dir & quot;). ডিরেক্টরির নাম উৎপন্ন হয় কিভাবে অস্থায়ী নিয়ন্ত্রণ - তার দৈর্ঘ্য কমাতে
  • ফোঁটা লেখা ত্রুটি লগ ইন করুন.
  • netcache_control
  • আংশিক ফোঁটা আহরণ অনুমতি দিন.
  • নতুন কমান্ড-সরান তাদের আইডি দ্বারা ব্লব মুছে দিন.
  • নতুন পরামিতি -auth ব্যবহার প্রমাণীকরণ স্ট্রিং উল্লেখ করতে পারবেন.
  • নতুন কমান্ড -reconf এবং -reinit NetCache অ্যাডমিনিস্ট্রেটরদের দ্বারা ব্যবহারের জন্য.
  • netschedule_control
  • সক্ষম সামঞ্জস্যের মোড পুরোনো কর্মী নোড সঙ্গে netschedule_control কাজ করা.
  • cgi2rcgi.cgi
  • অগ্রগতি বার্তা জন্য একটি স্থানধারক হিসেবে একটি খালি NetCache ফোঁটা তৈরি করবেন না.
  • ব্যবহারকারীকে জানানো হয় যে লগ গ্রিড ত্রুটি.
  • কাজ আইডি পরামিতি মধ্যে শূণ্যস্থান অনুমতি দিন.

  • JSON বিন্যাসে কাজ অবস্থা তথ্য
  • সমর্থন আউটপুট.
  • অনুমতি দিন কাস্টম এইচটিএমএল টেমপ্লেট গ্রিড ত্রুটি এবং অন্যান্য ইভেন্টের জন্য সংজ্ঞায়িত করা.
  • অন্তর্বর্তী ফলাফল ক্যাশে এড়ানোর জন্য কোন ক্যাশে HTTP- র হেডার যোগ করা হয়েছে.
  • ncfetch.cgi
  • নতুন পরামিতি পাসওয়ার্ড সুরক্ষিত ব্লব অ্যাক্সেস.
  • অতিরিক্ত পরামিতি, & quot ব্যাখ্যা; ফাইলের নাম, & quot; ডাউনলোড করা ফাইল জন্য একটি ফাইলের নাম হিসাবে.

2008 ডিসেম্বর 31 সংস্করণে নতুন কি:

  • এই রিলিজে কলাম নির্দিষ্ট গনা একটি পদ্ধতি যোগ করা হয়েছে সাই-বিস্ফোরণে pseudocounts.
  • এটা গ্রিড সেবা লাইব্রেরি refactors.
  • এটা সব ফাইল এপিআই শ্রেণীর জন্য ইউনিট পরীক্ষা কাঠামো এবং ত্রুটি লগিং যোগ করা হয়েছে.
  • এটা IRIX উপর pthread সমর্থন সমাধান করা হয়েছে. এটা এক্সএমএল serialization সমর্থন বাড়ায়.
  • এটা Sybase জন্য সমর্থন সমাধান করা হয়েছে.
  • এটি ছোট প্রশ্নের জন্য ছোট লুকআপ টেবিলের জন্য সমর্থন যোগ করা হয়েছে.
  • এটা length-লোডার পরিসংখ্যান উদ্ধার করা একটি API যোগ করা হয়েছে.
  • এটি অন্যান্য উন্নত বৈশিষ্ট্য, speedups, এবং বাগ হরেক রকম হয়েছে.

অনুরূপ সফ্টওয়্যার

DB Solo
DB Solo

17 Feb 15

Mergeant
Mergeant

2 Jun 15

Jude
Jude

3 Jun 15

TYPO3
TYPO3

26 Apr 16

মন্তব্য NCBI C++ Toolkit

পাওয়া মন্তব্যসমূহ না
মন্তব্য যোগ করুন
ছবি চালু!
বিভাগ দ্বারা অনুসন্ধান