Open Babel

ওপেন হট্টগোল একটি ওপেন সোর্স, বিশেষভাবে রাসায়নিক তথ্য অনেক ভাষায় চিনতে engineered একটি রাসায়নিক টুলবক্স হিসেবে কাজ করার জন্য ডিজাইন করা হয়েছে যে সহযোগীতা, বিনামূল্যে এবং multiplatform লাইব্রেরি সফটওয়্যার. এটা শুধু ডাব & ldquo হয়; দ্য ওপেন রসায়ন টুলকিট & rdquo;. একটি glanceWith ওপেন হট্টগোল বৈশিষ্ট্য, ব্যবহারকারী, অনুসন্ধান ও বিশ্লেষণ করা, রূপান্তর করতে সক্ষম, এবং রসায়ন, আণবিক মডেলিং, প্রাণরসায়ন, সেইসাথে অন্য সংশ্লিষ্ট এলাকা থেকে দোকান তথ্য পাবেন. এটা Mol2, এসডিএফ / mol, পিডিবি, xyz, হাসি, এবং CML সহ সাধারণ রাসায়নিক ফাইল ফরম্যাটের বিস্তৃত সমর্থন করে.
উপরন্তু, ওপেন হট্টগোল, একটি পূর্ণ বৈশিষ্ট্যযুক্ত প্রোগ্রামার এর টুলকিট, রাসায়নিক এমআইএমই সমর্থন উপলব্ধ করা হয় Matcher, নমনীয় পরমাণু / বন্ড Typer, হাইড্রোজেন অপসারণ এবং ছাড়াও, bitvector বর্গ, ম্যাট্রিক্স এবং ভেক্টর রূপান্তরের হিসাবে ভাল, একটি আণবিক পরীক্ষা suite.Under হিসেবে ফণা এবং smarts সমর্থিত অপারেটিং systemsOpen হট্টগোল C ++ প্রোগ্রামিং ভাষার মধ্যে সম্পূর্ণরূপে লেখা হয়. এটা & rsquo; গনুহ / লিনাক্স, বিএসডি, সোলারিস, এসজিআইয়ের, মাইক্রোসফট উইন্ডোজ এবং ম্যাক OS X অপারেটিং সিস্টেম সমর্থন করে SA সত্য ক্রস প্ল্যাটফর্ম সফ্টওয়্যার. উভয় 32 বিট এবং 64 বিট কম্পিউটারে আনুষ্ঠানিকভাবে this.Getting সব খুলুন BabelFirst দিয়ে শুরু লেখার সময় সমর্থিত হয়, আমরা দৃঢ়ভাবে ডিফল্ট সফটওয়্যার ভান্ডার থেকে প্রাক নির্মিত বাইনারি প্যাকেজ ব্যবহার করে ওপেন হট্টগোল ইনস্টল করার সুপারিশ আপনার লিনাক্স ডিস্ট্রিবিউশন. আপনার গনুহ / লিনাক্স সিস্টেম & rsquo করে না; Softoware দেওয়া সংরক্ষাণাগার সার্বজনীন সূত্র ব্যবহার করে আবেদন কম্পাইল এবং ইনস্টলেশন করতে হবে; T তারপর সেটির, তার Repos খুলুন হট্টগোল সফটওয়্যার আছে.
, Tarball রূপে (tar.gz আর্কাইভ) ডাউনলোড করুন আপনার পছন্দের একটি অবস্থান থেকে তা নিষ্কাশন, একটি টার্মিনাল এমুলেটর খুলুন, নিষ্কাশিত ফোল্ডার নেভিগেট এবং & ldquo চালানো;. Cmake & rdquo; (উদ্ধৃতি চিহ্ন বিনা) কমান্ড প্রকল্প কনফিগার করার জন্য. এর পরে, আপনি & ldquo চালানো হবে; না & rdquo; কমান্ড, কোট ছাড়া, অবশ্যই, এটা কম্পাইল করার. .

: যে পূর্বে উপরে নির্দেশাবলী আপনার অপারেটিং সিস্টেম ইনস্টল মধ্যে CMake টুল

এই রিলিজে নতুন কি দয়া করে নিশ্চিত করুন

• এই রিলিজে একটি প্রধান বাগ-ফিক্স রিলিজ প্রতিনিধিত্ব করে এবং দৃঢ়ভাবে ওপেন হট্টগোল এর সব ব্যবহারকারীদের জন্য প্রস্তাবিত একটি স্থিতিশীল আপগ্রেড করা উচিত. অনেক বাগ ও উন্নত বৈশিষ্ট্য 2.3.0 রিলিজ থেকে গত বছর যোগ করা হয়েছে.

কি সংস্করণ 2.2.2 নতুন:

• এই রিলিজে একটি প্রধান বাগ-ফিক্স রিলিজ প্রতিনিধিত্ব করে এবং দৃঢ়ভাবে ওপেন হট্টগোল এর সব ব্যবহারকারীদের জন্য প্রস্তাবিত একটি স্থিতিশীল আপগ্রেড হয়. অনেক নতুন বৈশিষ্ট্য, অনেক বিপর্যয় এবং অন্যান্য বাগ আছে নাও হতে পারে 2.2.1 থেকে সংশোধন করা হয়েছে.
• প্রমিত InChI এবং InChIKey আউটপুট উত্পাদন নতুন InChI 1.02 রিলিজ থেকে আপগ্রেড.
• হাসি লেখা / পড়া যখন অনেক ঘন-রাসায়ন ত্রুটি সংশোধন করা হয়েছে. এই 2.3 রিলিজের মধ্যে সমাপ্ত করা হবে, যা একটি বড় প্রকল্পের অংশ.

Cygwin এবং প্রতিটি ওয়েবসাইটেই PHP ল্যাঙ্গুয়েজ প্ল্যাটফর্ম
• স্থায়ী সংকলন এবং ইনস্টলেশন.
• উল্লেখযোগ্যভাবে উন্নত aromaticity এবং Kekule বন্ড নিয়োগ.
• উন্নত 2D - & gt; প্রজন্ম তুল্য 3D
• --gen3d কমান্ড-লাইন অপারেশন ব্যবহার করে প্রজন্মের তুল্য উন্নত

প্রজন্ম তুল্য জন্য
• উন্নত কর্মক্ষমতা.

হট্টগোল জন্য
• নতুন --fillUC কমান্ড-লাইন অপারেশন.

PH এর নির্ভর হাইড্রোজেন ছাড়াও সংশোধন করা হয়েছে
• .
• Molden, Molpro, এবং NWChem থেকে আউটপুট ফাইল কম্পন তথ্য পড়ার জন্য সমর্থন যোগ করা হয়েছে.
• সাম্প্রতিক তাত্ত্বিক হিসাব থেকে আপডেট পারমাণবিক ব্যাসার্ধ এতো.
• বাগ সংশোধন করা হয়েছে যখন gzip, কম্প্রেস Mol2 অথবা XML ফাইল পড়া.

একটি ত্রুটি পর
• বন্ধ ফাইল. ফাইল খোলা থাকবে যেখানে Pybel সঙ্গে একটি বাগ সংশোধন করা হয়েছে.
• আরও অনেক বাগ সংশোধন করা হয়েছে এবং ছোট বৈশিষ্ট্য উন্নতি. == নতুন ফাইল ফর্ম্যাট == আমদানি ও রপ্তানি:
• Molpro ইনপুট এবং আউটপুট.
• VASP তুল্য ফাইল (CONTCAR এবং POSCAR).

কি সংস্করণ 2.2.1 নতুন:

• পাইথন 3 সমর্থন সহ উন্নত স্ক্রিপ্টিং ইন্টারফেস, এবং উন্নত জাভা এবং C # সমর্থন.
• MACCS আঙ্গুলের ছাপ জন্য সমর্থন যোগ করা হয়েছে. RDKit প্রকল্প ধন্যবাদ.

বল ক্ষেত্রের কোড
• অনেক সংশোধন করা হয়েছে ও উন্নত বৈশিষ্ট্য. বিশেষ করে, UFF বল ক্ষেত্রের বাস্তবায়ন আরো অনেক অণু হ্যান্ডেল করা.
• 3D বিশেষ করে রিং টুকরা সঙ্গে, প্রজন্মের তুল্য উন্নত. আপনি এই obgen ইউটিলিটি সঙ্গে ব্যবহার করে দেখুন দিতে পারেন.
• পরমাণু ধরনের সঙ্গে পিডিবি আমদানি ত্রুটি বিভিন্ন সংশোধন করা হয়েছে.

PQR ফাইল ফরম্যাটের থেকে চার্জ এবং ব্যাসার্ধ এতো পড়ার জন্য
• সমর্থন যোগ করা হয়েছে.
• পিডিবি বিন্যাসে পড়া এবং লেখার ইউনিট কোষ জন্য সমর্থন যোগ করা হয়েছে.
• নতুন, & quot; আউটপুট, & quot; জেনেরিক, & quot নেওয়ার জন্য ফাইল ফরম্যাট, আউট- র- & quot ;, & quot; .log & quot ;, & quot; একটি- DAT, & quot; ফাইল এবং বিষয়বস্তুর উপর ভিত্তি করে উপযুক্ত ফাইল টাইপ সঙ্গে পড়া. বর্তমানে কোয়ান্টাম রসায়ন প্যাকেজ অত্যন্ত ভাল কাজ করে.
• ত্রুটি পরিচালনার ব্যবস্থা উন্নত এবং ফাইল ফরম্যাটের লোড যখন অক্ষম রিপোর্ট যোগ করা হয়েছে.
• উন্নত CIF ফাইল ফরম্যাট সমর্থন.
• অনেক, অনেক, অনেক অতিরিক্ত বাগ সংশোধন করা হয়েছে এবং ছোট উন্নত বৈশিষ্ট্য.