সফটওয়্যার স্ক্রিনশট:
সফটওয়্যার বিবরণ:
সংস্করণ: 1.65
তারিখ আপলোড: 1 Mar 15
ডেভেলপার: The Biopython Consortium
লাইসেন্স: বিনামূল্যে
জনপ্রিয়তা: 140
ডেভেলপারদের একটি আন্তর্জাতিক দল নির্মাতা এটা পাইথন লাইব্রেরি ও বায়োইনফরমেটিক্স বর্তমান এবং ভবিষ্যতে কাজ চাহিদা মোকাবেলার যা অ্যাপ্লিকেশন বিকাশ একটি বিতরণ সহযোগীতা প্রচেষ্টা.
নতুন কি এই রিলিজে:.
- Bio.Phylo এখন Yanbo তোমরা দ্বারা GSoC কাজ থেকে, গাছ নির্মাণ এবং ঐক্যমত্য মডিউল আছে
- Bio.Entrez এখন স্বয়ংক্রিয়ভাবে ডাউনলোড করুন এবং ব্যবহারকারীর ব্যক্তিগত ডিরেক্টরির অধীন পার্স XML এর জন্য নতুন NCBI নথি প্রকার সংজ্ঞা ফাইল ক্যাশে করা হবে (সিস্টেমের মত ইউনিক্স ~ / .biopython ব্যবহার করে, এবং উইন্ডোজ $ C: / biopython).
- Bio.Sequencing.Applications এখন samtools কমান্ড লাইন টুল জন্য একটি লেফাফা অন্তর্ভুক্ত করা হয়েছে.
- Bio.PopGen.SimCoal এখন fastsimcoal সমর্থন করে.
- SearchIO hmmer3 টেক্সট, hmmer3-ট্যাব, এবং hmmer3-domtab এখন hmmer3.1b1 থেকে আউটপুট সমর্থন করে.
- BioSQL এখন MySQLdb একটি বিকল্প হিসাবে (পাইথন 2, 3 এবং PyPy জন্য উপলব্ধ) মাইএসকিউএল সংযোগকারী প্যাকেজ ব্যবহার করতে পারেন (পাইথন শুধুমাত্র 2) একটি মাইএসকিউএল ডাটাবেসের সাথে সংযোগ করার.
কি সংস্করণ 1.63 নতুন:
- এখন বিল্ট ইন পাইথন 3 শৈলী পরের ফাংশন ব্যবহার করে পাইথন 2 শৈলী iterators 'পরবর্তী স্থানে () পদ্ধতি.
- বর্তমান সংস্করণ 2to3 গ্রন্থাগারের প্রয়োজন সরানো.
কি সংস্করণ 1.62 নতুন:.
আনুষ্ঠানিকভাবে পাইথন 3 <সমর্থন করে
- Biopython এর প্রথম রিলিজ / Li>
সংস্করণ 1.60 নতুন কি,
- নতুন মডিউল Bio.bgzf পড়া এবং লেখার BGZF ফাইল (সমর্থন অবরুদ্ধ গনুহ জিপ ফরম্যাট), দক্ষ র্যান্ডম এক্সেস সঙ্গে GZIP একটি বৈকল্পিক, সবচেয়ে বেশি এবং BAM ফাইল ফরম্যাট এর এবং tabix অংশ হিসাবে ব্যবহার.
- length-/ EMBL পার্সার এখন অচেনা বৈশিষ্ট্য অবস্থানের উপর একটি সতর্কবার্তা দিতে এবং (কেউ যেমন বৈশিষ্ট্য এর অবস্থান যাব) পার্সিং চলতে থাকবে.
- Bio.PDB.MMCIFParser এখন ডিফল্ট দ্বারা কম্পাইল (কিন্তু এখনও jython, PyPy বা পাইথন 3 এর অধীন উপলব্ধ নয়) করা হয়.
সংস্করণ 1.59 নতুন কি:
- নতুন মডিউল Bio.TogoWS TogoWS বাকি জন্য একটি লেফাফা প্রস্তাব API- টি.
- NCBI প্রবেশ করুন পান ফাংশন Bio.Entrez.efetch EFetch 2.0 একাধিক আইডি আর্গুমেন্ট NCBI এর কঠোর হ্যান্ডলিং হ্যান্ডেল আপডেট করা হয়েছে.
কি সংস্করণ 1.58 নতুন:
- PAML জন্য একটি নতুন ইন্টারফেস এবং পারজার (ফাইলোজেনেটিক বিশ্লেষণ দ্বারা সর্বাধিক সম্ভাবনা) প্রোগ্রাম একটি প্যাকেজ, সমর্থন codeml, baseml এবং yn00 হিসেবে chi2 একটি পাইথন পুনরায় বাস্তবায়ন Bio.Phylo.PAML মডিউল হিসেবে যোগ করা হয়েছিল.
- Bio.SeqIO এখন পড়া এবং ABI ফাইল সমর্থন করে (& quot; Sanger, & quot; কৈশিক সিকোয়েন্সিং ট্রেস ফাইল, PHRED গুণাবলী সঙ্গে ধারণকারী বলা ক্রম) .
- Bio.AlignIO, & quot; fasta-M10, & quot; বিল পিয়ারসন এর FASTA সংস্করণ 3.36 হিসাবে ব্যবহৃত পার্সার মার্কার লাইন সঙ্গে মানিয়ে নিতে আপডেট করা হয়েছে.
সংস্করণ 1.57 নতুন কি:.
- Biopython এখন পিপ সঙ্গে ইনস্টল করা যাবে করুন
সংস্করণ 1.56 নতুন কি:
- Bio.SeqIO মডিউল সমর্থন আপডেট করা হয়েছে প্রোটিন EMBL (পেটেন্ট ডাটাবেসের জন্য ব্যবহৃত) ফাইল (উরি Laserson থেকে সাহায্য EMBL ফাইল ফরম্যাট একটি বৈকল্পিক,) IMGT ফাইল, এবং UniProt এক্সএমএল ফাইল.
কি সংস্করণ 1.55 নতুন:
- কাজ অনেক মাধ্যমে (পাইথন 3 সমর্থন প্রতি হয়েছে 2to3 স্ক্রিপ্ট), কিন্তু আমরা কিছু ভেঙে যদি না আপনি কোনো পরিবর্তন লক্ষ্য করা উচিত.
- নতুন বৈশিষ্ট্য নিরিখে, সবচেয়ে লক্ষণীয় হাইলাইট কমান্ড লাইন টুল আবেদন আলোয়ান ক্লাস এটা অনেক সহজ বহিরাগত সরঞ্জাম কল করা উচিত, যা, এখন এক্সিকিউটেবল হয়.
আবশ্যক
- পাইথন 2.6 বা উচ্চতর
পাওয়া মন্তব্যসমূহ না