Bioinformatics Benchmark System

সফটওয়্যার স্ক্রিনশট:
Bioinformatics Benchmark System
সফটওয়্যার বিবরণ:
সংস্করণ: 3
তারিখ আপলোড: 3 Jun 15
ডেভেলপার: Joe Landman
লাইসেন্স: বিনামূল্যে
জনপ্রিয়তা: 48

Rating: 4.0/5 (Total Votes: 1)

বায়োইনফর্মেটিকস বেঞ্চমার্ক সিস্টেম, একটি যুক্তিসঙ্গত পরীক্ষার কাঠামো, পরীক্ষা, এবং তথ্য গড়ে তুলতে তাদের সিস্টেমের কর্মক্ষমতা তদন্ত অন্তিম ব্যবহারকারীদের এবং বিক্রেতাদের সক্ষম করার জন্য একটি প্রচেষ্টা.
আমরা কি করতে চেষ্টা করছেন পরীক্ষার জন্য একটি কাঠামো, এবং সব ডাউনলোড করুন সিস্টেম কর্মক্ষমতা নির্দিষ্ট উপাদানের অনুসন্ধানের ব্যবহার করতে পারেন যে পরীক্ষার একটি কোর সেট তৈরি হয়.
তাছাড়া, এই পরীক্ষার সোর্স GPL এর অধীনে পাওয়া যায়, এবং ধারণা সহজেই পরিমাপ এবং সাময়িক কারণে অর্থপূর্ণ পরীক্ষা নির্মাণ এবং ব্যবহার অন্তিম ব্যবহারকারীদের, ভোক্তাদের, সিস্টেম ডেভেলপারদের, এবং অন্যদের সক্ষম হয় Bioinformatics.org এবং আকার পরিবর্তনযোগ্য ইনফরমেটিক্স এলএলসি হোস্ট করা হয় .
আকার পরিবর্তনযোগ্য ইনফরমেটিক্স এলএলসি থেকে জো Landman ধারণা এবং মূল কোড লিখেছেন. আমরা ইত্যাদি অতিরিক্ত মাত্রাবিশিষ্ট কোড পরামর্শ, পরীক্ষা, তথ্য সেট, খুঁজছি হয়
বর্তমান বেসলাইন পরীক্ষা, বিভিন্ন NCBI ব্লাস্ট রান বিভিন্ন HMMer রান, এবং অন্যদের বিভিন্ন হয়. আমরা ClustalW, এক্স! অবশেষে, বিভিন্ন রসায়ন, গতিবিদ্যা, এবং সংশ্লিষ্ট পরীক্ষা, সেইসাথে বিভিন্ন অন্যদের অন্তর্ভুক্ত করার পরিকল্পনা.
যেমন LINPACK বা HPL হিসাবে টেস্ট কেবল উচ্চ কার্যকারিতা ইনফরমেটিক্স জন্য অর্থপূর্ণ কর্মসম্পাদক বা ভবিষ্যদ্বাণীপূর্ণ মডেল উপলব্ধ করা হয় না. দুর্ভাগ্যবশত, কিংবা আরো সাম্প্রতিক শ্রেনীর পরীক্ষার একটি সংখ্যা না.
এই বিশেষভাবে আপনি কার্যকরভাবে নিয়মিত মেমরি এক্সেস নিদর্শন, এবং নির্দিষ্ট গাণিতিক অপারেশন আছে যেখানে বিভিন্ন ম্যাট্রিক্স অপারেশন, কার্যক্ষমতা পরীক্ষণ LINPACK এবং HPL হিসাবে একটি সমস্যা.
এই কোড ভারী ফ্লোটিং পয়েন্ট অপারেশন সঙ্গে কোড তুলনায়, এবং দর্শন অন্তর্বর্তীবিরতি মেমরি ট্রাফিকের জন্য সবচেয়ে উপযোগী. এই কোড ডিস্ক ইনপুট / আউটপুট, মেমরি লেটেন্সি, এবং অন্যান্য কারণের সব কর্ম সংক্রান্ত সমস্যা অবদান যেখানে ব্যাপক সিস্টেম মাপকাঠিতে, জন্য ডিজাইন করা হয়েছে.
সেরা পরীক্ষা আপনি মেশিন চালানো হবে কোড সবচেয়ে অনুরূপ যে ওগুলো. পরীক্ষা নিজেদের বাস্তব তথ্য ব্যবহার করে আপনার কোড একটি বাস্তব সঞ্চালনের যুক্তিসঙ্গত অনুমান করা উচিত. আপনি বাস্তবসম্মত রান বার পেতে যাতে এটা ফিরে pare করার প্রয়োজন হতে পারে.
আপনি তথ্য আকারের একটি যুক্তিসঙ্গত উপসেট থাকা উচিত. একটি একক পরীক্ষা আপনার সিস্টেম দাঁড়িপাল্লা কিভাবে আপনি বলুন না, এবং এই পরীক্ষার existance জন্য কারণ হল যে আপনি কাজের চাপ বিভিন্ন দিক বৃদ্ধি যখন আপনি কর্মক্ষমতা পরীক্ষা করার অনুমতি বিশেষভাবে.
আপনি খুব কমই একটি ক্লাস্টারের মধ্যে একটি অনুচ্চারিত সিস্টেম পেতে, যাতে আপনি যতটা সম্ভব বাস্তবসম্মত একটি অপারেটিং পরিবেশে চালানোর চেষ্টা যে আমরা কথা বলতে চাই. একটি অনুচ্চারিত সিস্টেমের মধ্যে একটি বেসলাইন জরিমানা, কিন্তু এটা নিরর্থক আপনার প্রত্যাশা সেট করতে পারেন.
শীর্ষ

অনুরূপ সফ্টওয়্যার

Orthanc
Orthanc

18 Jul 15

PathVisio
PathVisio

18 Feb 15

MetagenomeDB
MetagenomeDB

12 May 15

মন্তব্য Bioinformatics Benchmark System

পাওয়া মন্তব্যসমূহ না
মন্তব্য যোগ করুন
ছবি চালু!