SPInDel workbench

সফটওয়্যার স্ক্রিনশট:
SPInDel workbench
সফটওয়্যার বিবরণ:
সংস্করণ: 1.0.1
তারিখ আপলোড: 27 May 15
ডেভেলপার: GEPO
লাইসেন্স: বিনামূল্যে
জনপ্রিয়তা: 6
আকার: 19934 Kb

Rating: 1.0/5 (Total Votes: 1)

SPInDel ribosomal আরএনএ (rRNA) জিন অঞ্চলে দৈর্ঘ্যের উপর ভিত্তি করে জৈব সনাক্ত করার জন্য একটি বিকল্প পন্থা. সাধারণভাবে, বিভিন্ন প্রজাতি থেকে প্রাথমিক rRNA জিন সিকোয়েন্স alignments, উভয় নিউক্লিওটাইড বদল শর্তাবলী (সাধারণত "SNPs" বলা হয়) এবং সন্নিবেশ / মুছে ফেলার (indel) ঘটনা নিউক্লিওটাইড সংরক্ষণ এবং প্রকরণের পর্যায়ক্রমে অঞ্চলে প্রদর্শন. "-" বিভিন্ন লেন্থ ক্রমের মধ্যে indels ফলাফল উপস্থিতি এবং সাধারণত একটি ড্যাশ দ্বারা প্রকাশ করা প্রান্তিককরণ ফাঁক, প্রবর্তন করে.
সংরক্ষিত অঞ্চলে পরিবর্তনশীল অংশ ক্রম সংমিশ্রণ প্রতিটি প্রজাতির (একটি "SPInDel প্রোফাইল") এর বৈশিষ্ট হল লেন্থ যা ("SPInDel hypervariable অঞ্চলে") নির্ধারণ করতে ব্যবহৃত হয় নিম্নরূপ: জৈব সনাক্ত করার জন্য আমাদের ধারণা rRNA জিন সিকোয়েন্স ব্যবহার করে. সুতরাং, প্রতিটি প্রজাতির একটি অনন্য সাংখ্যিক প্রোফাইল দ্বারা সংজ্ঞায়িত করা যেতে পারে.
তত্ত্ব, 20 অ্যালিল প্রতিটি (বা 5 অ্যালিল প্রতিটি সঙ্গে 11 অঞ্চলে) সঙ্গে মাত্র 6 hypervariable অঞ্চলে একটি জরিপ সংখ্যা 5 মিলিয়ন থেকে 15 হতে পারে বলে অনুমান করা হয়, যা পৃথিবীর সব ইউক্যারিওটিক প্রজাতির, বৈষম্য যথেষ্ট. বাস্তবে, SPInDel কম intraspecific প্রকরণ এবং উচ্চ ফাইলোজেনেটিক রেজোলিউশনে ইউক্যারিওটিক প্রজাতির 93,3% বৈষম্য করতে সক্ষম হয়.

সমর্থিত অপারেশন সিস্টেম

অনুরূপ সফ্টওয়্যার

Reack
Reack

2 Apr 18

StarStrider
StarStrider

27 May 15

Combi
Combi

2 Apr 18

MATruss
MATruss

26 May 15

মন্তব্য SPInDel workbench

পাওয়া মন্তব্যসমূহ না
মন্তব্য যোগ করুন
ছবি চালু!
বিভাগ দ্বারা অনুসন্ধান