mpiBLAST NCBI ব্লাস্টের একটি এমপিআই ভিত্তিক সমান্তরাল বাস্তবায়ন. প্রকল্প formatdb প্রতিস্থাপন এবং ইনস্টল এমপিআই সঙ্গে কম্পিউটারের একটি ক্লাস্টারের সমান্তরাল বিস্ফোরণে কাজ চালানো যে সংস্করণের সাথে blastall যে প্রোগ্রাম একজোড়া নিয়ে গঠিত. ঐতিহ্যগত ব্লাস্ট বনাম mpiBLAST ব্যবহার করে দুটি প্রধান সুবিধা আছে.
প্রথমত, mpiBLAST ক্লাস্টারের মধ্যে প্রতিটি নোডের জুড়ে ডাটাবেস splits. ডাটাবেস প্রতিটি নোড এর সেগমেন্ট কারণ ছোট এটা সাধারণত কারণে ডিস্ক ইনপুট / আউটপুট বর্জন একটি গুরুত্বপূর্ণ speedup প্রদায়ক, বাফার-ক্যাশের মধ্যে বসবাস করতে পারেন. দ্বিতীয়ত, এটি interprocessor যোগাযোগ দাবী কম কারণ ব্লাস্ট ব্যবহারকারীদের দক্ষ, কম খরচে Beowulf ক্লাস্টার সুবিধা গ্রহণ করতে পারবেন.
mpiBLAST ডাটাবেস উপস্থিত RAM- র মধ্যে মাপসই অত্যন্ত বড় পরিস্থিতিতে যেখানে সুপার-রৈখিক speedup অর্জন, এবং অন্যান্য পরিস্থিতিতে রৈখিক speedup কাছাকাছি. এটি একটি ডেডিকেটেড ক্লাস্টার প্রয়োজন হয় না.
আবশ্যক:
পাওয়া মন্তব্যসমূহ না