মানুষের জিনোম এবং transcriptomes এবং চরিত্রায়ন অনুসন্ধান, একটি আকার পরিবর্তনযোগ্য ফলাফল ডাটাবেস এবং পরিচালনার জন্য একটি ব্যবহারকারী বান্ধব ওয়েব ভিত্তিক সফ্টওয়্যার অ্যাপ্লিকেশন সঙ্গে একসঙ্গে
CaPSID একটি ব্যাপক ওপেন সোর্স প্যাথোজেন ক্রম সনাক্তকরণ & nbsp জন্য একটি উচ্চ ক্ষমতা সম্পন্ন গণনীয় পাইপলাইন সংহত যা প্ল্যাটফর্ম এবং ফলাফল visualizing.
শুরু
আপনি একটি পাইথন 2.6+ ইনস্টলেশন ও Apache হুল বিড়াল 6 + একটি MongoDB ডাটাবেস প্রয়োজন হবে. অধিক বিবরণের জন্য, উইকি পড়ুন:
- সংশোধন করা হয়েছে: http://wiki.github.com/capsid/capsid/home
What এই রিলিজে নতুন ত্রুটি বার্তা বিয়োগ এবং প্রান্তিককরণ যখন চলমান পাওয়া যায় না
- দীর্ঘ চলমান প্রশ্নের স্থাপন উপর আরো কাজ করুন
কি সংস্করণ 1.4.2 নতুন:
- মুছে ফেলা হবে MongoKit নির্ভরতা
কি সংস্করণ 1.4.1 নতুন:
- দীর্ঘ চলমান পরিসংখ্যান প্রশ্নের জন্য সংশোধন করা হয়েছে কার্সার সময়সীমার
কি সংস্করণ 1.4.0 নতুন:
- তারা সব চেয়ে বরং চালানো হচ্ছে, যখন যুক্ত পরিসংখ্যান শেষে
- uid এবং যেমন জিন জন্য অনন্য আইডি সঞ্চয় করুন
সংস্করণ 1.2.7 নতুন কি:
- সংশোধন করা হয়েছে উপস্থিত README
কি সংস্করণ 1.2.6 নতুন:
বিয়োগ ম্যাপ নির্মাণের সময় unmapped
সংস্করণ 1.2 নতুন কি:
- unmapped সার্চ থেকে FastQ ফাইল তৈরি করতে ইউটিলিটি
- ইউটিলিটি FastQ ফাইল ছেদ ফিরে করুন
- ইউটিলিটি ফিল্টার FastQ ফাইল ফিরে করুন
- যোগ করা হয়েছে mapq থ্রেশহোল্ড পতাকা বিয়োগ
- Gbloader এখন ব্যাকটেরিয়া এবং গড়তে পারলেও ছত্রাক জেনোমের লোড করতে পারেন
- GridFS ব্যবহার করে ডাটাবেস জিনোম সিকোয়েন্স সঞ্চয় করুন
- কমিয়ে মেমরি পদাঙ্ক পরিসংখ্যান হিসাবী যখন
- ব্যবহার subprocesses পরিবর্তে os.system এর
- mapq স্কোর ফিল্টার 0 অন্তর্ভুক্ত করা প্রয়োজন
কি সংস্করণ 1.1 নতুন:
- জোড়া শেষ জন্য সমর্থন সার্চ যোগ করুন
সংস্করণ 1.0.1 নতুন কি:
- MongoDB অনুমোদনের জন্য সমর্থন যোগ করা হয়েছে
আবশ্যক
- পাইথন
পাওয়া মন্তব্যসমূহ না