BioJava

এটি সাধারণ ফাইল ফরম্যাটের জন্য বিশ্লেষণাত্মক এবং পরিসংখ্যান রুটিন, পারজার উপলব্ধ করা হয় এবং সিকোয়েন্স এবং 3D স্ট্রাকচার ম্যানিপুলেশন.

এই রিলিজে নতুন আপনি কি:.

<লি> সঙ্গতিপূর্ণভাবে ত্রুটি লগিং. SLF4J লগিং জন্য ব্যবহার করা হয় এবং সব প্রধান লগিং বাস্তবায়নের জন্য অ্যাডাপ্টার উপলব্ধ করা হয়.

ব্যতিক্রম <লি> উন্নত হ্যান্ডলিং.

<লি> অপসারিত অবচিত পদ্ধতি.

<লি> BioJava টিউটোরিয়াল সম্প্রসারিত.

<লি> আপডেট সংক্রান্ত নির্ভরতা যেখানে প্রযোজ্য.

মাভেনের সেন্ট্রাল এ উপলব্ধ <লি>.



সংস্করণ 4.0.0 নতুন আপনি কি:

• সঙ্গতিপূর্ণভাবে ত্রুটি লগিং. SLF4J লগিং জন্য ব্যবহার করা হয় এবং সব প্রধান লগিং বাস্তবায়নের জন্য অ্যাডাপ্টার উপলব্ধ করা হয়.
  
  ব্যতিক্রম <লি> উন্নত হ্যান্ডলিং.
  
  <লি> অপসারিত অবচিত পদ্ধতি.
  
  <লি> BioJava টিউটোরিয়াল সম্প্রসারিত.
  
  <লি> আপডেট সংক্রান্ত নির্ভরতা যেখানে প্রযোজ্য.
  
  মাভেনের সেন্ট্রাল এ উপলব্ধ <লি>.
  
  

আপনি কি সংস্করণ 3.1.0 মধ্যে নতুন:

• নতুন বৈশিষ্ট্য:
  
  <লি> অতিরিক্ত পরামিতি সঙ্গে সিই-সিপি সংস্করণ 1.4,
  
  <লি> ব্যাপ্তি 2.04 যাও আপডেট করুন

<লি> পার্সিং FASTQ উন্নতি

পার্সিং পিডিবি
• বাগ ফিক্স করুন

<লি> কাঠামো বিন্যাস মধ্যে ক্ষুদ্র সংশোধন করা হয়েছে



সংস্করণ 3.0.8 নতুন আপনি কি:

• নতুন:
  
  <লি> Genbank লেখক করুন

<লি> UCSC থেকে Karyotype ফাইলের জন্য পার্সার করুন
<লি> UCSC থেকে জিন অবস্থানের জন্য পার্সার করুন
<লি> জিন নামের জন্য পার্সার genenames.org থেকে ফাইল

<লি> বেঁচে বিশ্লেষণের জন্য কক্সবাজার নির্ভরণ কোড মডিউল

<লি> অ্যাক্সেসযোগ্য ভূপৃষ্ঠের ক্যালকুলেশন (এএসএ)

<লি> .OBO ফাইল পার্সিং জন্য মডিউল (ontologies)

<লি> উন্নত:

<লি> SCOP এবং বার্কলে-SCOP শ্রেণীবিভাগেরও প্রতিনিধিত্ব করুন


সংস্করণ 3.0.7 নতুন আপনি কি:

• একটি মৌলিক genbank পার্সার যোগ করুন
.
এন সঙ্গে codons অনুবাদ যখন <লি> একটি সমস্যা সংশোধন করা হয়েছে.

<লি> এখন প্রোটিন স্ট্রাকচার মধ্যে বন্ড আবিষ্কার করতে পারেন.

<লি> জীব ও মত প্রকাশের সিস্টেমের জন্য mmcif রেকর্ড বিশ্লেষণ করতে সমর্থন যোগ করা হয়েছে.

<লি> অনেক ছোট ছোট বাগ সংশোধন করা হয়েছে ও উন্নত বৈশিষ্ট্য.



সংস্করণ 3.0.6 নতুন আপনি কি:

• উন্নয়ন এ গিটহাব সরানো: HTTPS: // github.com/biojava/biojava করুন



সংস্করণ 3.0.5 নতুন আপনি কি:.

• ক্যাথ সাইট জন্য নতুন পার্সার করুন

<লি> স্টকহোম ফাইল ফরম্যাট জন্য নতুন পার্সার.

<লি> প্রোটিন স্ট্রাকচার জৈবিক সমাহারগুলি উল্লেখযোগ্যভাবে উন্নত উপস্থাপনা. এখন সামঁজস্যহীন ইউনিট থেকে জৈব সমাবেশ পুনরায় তৈরি করতে পারেন.

<লি> কিছু বাগ সংশোধন করা হয়েছে.



সংস্করণ 3.0.4 নতুন কি:

এই বিষয় অ্যাড্রেসিং প্রধানত একটি বাগ ফিক্স রিলিজ

• প্রোটিনের কাঠামো ও বিশৃঙ্খলা মডিউল.
  
  <লি> একটি নতুন বৈশিষ্ট্য:. SCOP তথ্য এখন হয় ইউ বা বার্কলে সংস্করণে মূল SCOP সাইট থেকে ব্যবহার করা যাবে করুন



সংস্করণ 3.0.3 নতুন আপনি কি:

• ওয়েব পরিষেবা মডিউল উল্লেখযোগ্য উন্নতি (NCBI বিস্ফোরণে এবং hmmer ওয়েব সার্ভিস).
  
  <লি> & quot; নতুন & quot; (সংস্করণ থেকে 3 biojava 1 সিরিজ থেকে বৈশিষ্ট্যসমূহ নিয়ে আসা) fastq পার্সার.
  
  <লি> UniProt ম্যাপিং sifts-পিডিবি জন্য সমর্থন.
  
  <লি> Protmod মডিউল modfinder নামকরণ করা.
  
  

সংস্করণ 3.0.2 নতুন আপনি কি:

• প্রোটিন গঠন: প্রোটিন ডোমেইনের উন্নত হ্যান্ডলিং: এখন SCOP সমর্থন. প্রোটিন ডোমেন পার্সার ভিত্তিক প্রোটিন ডোমেইনের স্বয়ংক্রিয় ভবিষ্যদ্বাণী, এর জন্য নতুন কার্যকারিতা.
  
  <লি> একাধিক অন্যান্য মডিউল ক্ষুদ্র উন্নতি ও বাগ সংশোধন করা হয়েছে.
  
  <লি> biojava3-এএ-ঠেকনা: এই নতুন মডিউল ভৌত রাসায়নিক ও প্রোটিন ক্রম অন্য বৈশিষ্ট্য হিসাব করতে পারবেন
.
<লি> biojava3 প্রোটিন-ব্যাধি: প্রোটিন এ গুলান অঞ্চলে পূর্বাভাস জন্য একটি নতুন মডিউল. RONN Predictor একটি জাভা বাস্তবায়নের উপর ভিত্তি করে এটি.



আপনি কি সংস্করণ 3.0.1 মধ্যে নতুন:

• 3.0.1 রিলিজ প্রধানত একটি বাগ ফিক্স biojava কোড বেস প্রধান লেখা দেওয়া যা মুক্তি সাম্প্রতিক 3.0 জন্য মুক্তি.
  
  

আবশ্যক :

• জাভা 1.6 বা উচ্চতর করুন


10 Dec 15 মধ্যে শিক্ষাগত ও বিজ্ঞান সরঞ্জাম স্ক্রিপ্ট