edittag প্ল্যাটফর্ম-নির্দিষ্ট সিকোয়েন্সিং অ্যাডাপ্টার এবং PCR primers ক্রম ট্যাগ, সম্পাদনা মেট্রিক ক্রম ট্যাগ সেট নকশা সম্পাদনা মেট্রিক আকার জন্য ক্রম ট্যাগ চেক, এবং একীভূত জন্য একটি অ্যাপ্লিকেশন সংগ্রহ. edittag অন্যান্য পন্থা থেকে পৃথক:
& Nbsp; * edittag মাল্টি-ব্যবহার যুক্তিসঙ্গত সময় ফ্রেম সম্পাদনা মেট্রিক ক্রম ট্যাগ নির্বিচারে লেন্থ তৈরি করে
& Nbsp; * edittag সম্পাদনা মেট্রিক ক্রম ট্যাগ সেট নির্বাচিত সম্পাদনা দূরত্ব সাথে সামঞ্জস্য তৈরি করে
& Nbsp; * edittag ব্যবহার primer3 PCR primers ক্রম ট্যাগ সংহত
আমরা নিম্নলিখিত বিন্যাসে edittag ব্যবহার করে ডিজাইন সম্পাদনা মেট্রিক ক্রম ট্যাগ বেশ কয়েকটি সেট প্রদান:
& Nbsp; * টেক্সট - এই ফাইল check_levenshtien_distance.py জন্য একটি উপযুক্ত বিন্যাসে
& Nbsp; * CSV
& Nbsp; * SQLite ডাটাবেস
উদ্ধৃতি
Faircloth বিসি, গ্লেন সাইট. সম্পাদনা মেট্রিক ক্রম সনাক্তকরণ বড় সেট
ব্যাপক থেকে সার্চ ট্যাগ বড় মাপের multiplexing সহজতর
সমান্তরাল সিকোয়েন্সিং. doi_
ইনস্টলেশন:
easy_install
easy_install edittag
tar.gz
wget হয় package.tar.gz
আলকাতরা -xzf package.tar.gz
পাইথন ইনস্টল setup.py
সংগ্রহস্থলের
Git ক্লোন Git: //github.com/baddna/edittag.git edittag
ঐচ্ছিক প্যাকেজ (PY-Levenshtein)
wget হয় http://pylevenshtein.googlecode.com/files/python-Levenshtein-0.10.1.tar.bz2
আলকাতরা -xzvf ময়াল সাপ-Levenshtein-0.10.1.tar.bz2
পাইথন ইনস্টল setup.py
ঐচ্ছিক প্যাকেজ (primer3)
আপনি সম্পাদনা মেট্রিক ক্রম ট্যাগ একত্রিত primers ডিজাইন করতে চান, তাহলে প্রথমে আপনাকে primer3 একটি পরিমার্জিত সংস্করণ ইনস্টল করতে হবে:
Git ক্লোন Git: //github.com/baddna/mod-primer3.git
সিডি মুডে-primer3 / src
করা
ইনস্টল করা
আপনি আপনার পাথ একটি অবস্থান গেলিক ভাষার-primer3 থেকে বাইনারি সরানো নিশ্চিত করুন যে (অন্তত primer3 দীর্ঘ সরানো এবং আপনার পাথ একই ডিরেক্টরির মধ্যে primer3_config). তারপর আপনি চালাতে পারেন?
আবশ্যক
- পাইথন
- ব্যবহৃত NumPy
- Levenshtein
- গেলিক ভাষার-primer3
পাওয়া মন্তব্যসমূহ না