CodonW Codon এবং অ্যামিনো অ্যাসিড ব্যবহারের multivariate বিশ্লেষণ (চিঠিপত্রের বিশ্লেষণ) প্রক্রিয়া সহজ করার জন্য ডিজাইন করা একটি প্রোগ্রাম. এটি Codon ব্যবহারের স্ট্যান্ডার্ড সূচকের হিসাব. এটা মেনু এবং কমান্ড-লাইন থেকে ইন্টারফেস উভয় আছে.
CodonW প্রকল্প পল শার্প, জেনেটিক্স এর DEPT, নটিংহ্যাম বিশ্ববিদ্যালয়ের ল্যাবের জন Peden দ্বারা লিখিত হয়. জন হিউম্যান জেনেটিক্স অধিকৃত হয়ে গেছে এবং বর্তমানে অক্সফোর্ড বিশ্ববিদ্যালয়ে WTCHG এ ProCardis ডাটাবেস ম্যানেজার হিসেবে নিযুক্ত করা হয়.
এখানে "CodonW" কিছু মূল বৈশিষ্ট্য হল:
· ANSI অনুবর্তী সি
· মেনু চালিত
· কমাণ্ড লাইন অপশন সম্বন্ধে ব্যাপক সংখ্যা
· জেনেটিক কোড স্বাধীন
উপর · কোন সীমা
ক্রম 1. সংখ্যা
2. ক্রম দৈর্ঘ্য
· Codon ব্যবহার সূচকের হিসাব
1. CAI: Codon অভিযোজন সূচক
2. ফুলবাবু: অনুকূল codons এর ফ্রিকোয়েন্সি
3. Nc: codons কার্যকরী সংখ্যা
4. সিবিআই: Codon বায়াস সূচক
· অ্যামিনো অ্যাসিড সূচকের হিসাব
1. রসা স্কোর
2. অ্যারোমেটিসিটির
· এর চিঠিপত্রের বিশ্লেষণ হিসাব
1. Codon ব্যবহার
2. RSCU (আপেক্ষিক সমার্থক Codon ব্যবহার)
3. অ্যামিনো অ্যাসিড ব্যবহার
· চিঠিপত্রের বিশ্লেষণ
1. / অন্তর্ভুক্ত codons / অ্যামিনো অ্যাসিড অগ্রাহ্য করতে পারেন
2. প্রবণতা বিস্তারিত রিপোর্ট তৈরি করতে পারেন
3. প্রচেষ্টা স্বয়ংক্রিয়ভাবে অনুকূল codons চিহ্নিত করা
4. অতিরিক্ত তথ্য অনুমতি দিতে পারেন যোগ করা সেট
5. প্রবণতা যে কোন সংখ্যার রেকর্ড
· জিন পরামিতি হিসাব
1. জিন দৈর্ঘ্য
2. জিসি, GC3s এবং Codon অবস্থান নির্দিষ্ট জি + সি
3. Dinucleotide রচনা (সব তিনটি Codon ফ্রেম)
4. অ্যামিনো অ্যাসিড ব্যবহার
5. আপেক্ষিক অ্যামিনো অ্যাসিড ব্যবহার
6. Codon ব্যবহার
7. আপেক্ষিক সমার্থক Codon ব্যবহার
· সম্ভব ধারণার প্রোটিন ক্রম অনুবাদ
· ক্রম তথ্য reformats
· হিউম্যান বা মেশিন রিডেবল আউটপুট
· (সংরক্ষণের পড়ার ফ্রেম যখন) জিন কনক্যাটেনেট পারি নিরূপণ
1. সামগ্রিক Codon ব্যবহার
2. জিসি কন্টেন্ট
3. Dinucleotide রচনা
· Codon টেবিল অ্যামিনো অ্যাসিড, বা RSCU ব্যবহার উত্পন্ন
· এমনকি আপনি জেনেটিক কোড জানতে সাহায্য করতে পারেন.
· এবং আরো
পাওয়া মন্তব্যসমূহ না