বিনামূল্যে বায়োইনফরম্যাটিকস জন্য Linux

সীল Hadoop উপর ক্রম প্রান্তিককরণ প্রদান করে একটি পাইথন মডিউল.সীল জৈব ক্রম প্রান্তিককরণ জন্য একটি MapReduce এর আবেদন. এটা Pydoop মাধ্যমে Hadoop (http://hadoop.apache.org) (http://pydoop.sourceforge.net), Hadoop জন্য একটি পাইথন MapReduce এবং HDFS API- র উপর...

. TRMiner একটি পাইথন বৈজ্ঞানিক তথ্য curators এ লক্ষ্যে কাজ করে উপযোগ & nbsp হয়, এটি দ্রুত একটি প্রদত্ত খনির লক্ষ্য জন্য প্রাসঙ্গিক বাক্য বৈজ্ঞানিক প্রকাশনা বড় সংগ্রহের আলুবোখারা করতে পারবেন.এই দুটি ধাপে অর্জিত হয়. প্রথমত, গ্রন্থে প্রাসঙ্গিক শব্দ টোকেন...

. Pysam পড়া এবং Samfiles সাধিত & nbsp জন্য একটি পাইথন মডিউল; এটা samtools সি API- এর একটি লাইটওয়েট আলোয়ান না.দ্রুত শুরু গাইড এখানে. আরো বিস্তারিত ডকুমেন্টেশন এখানে পাওয়া যায়.প্রশ্ন এবং মন্তব্য খুব স্বাগত জানাই এবং...

PySCeS আনবিক সেল শারীরবিদ্যার & nbsp জন্য ট্রিপল জে গ্রুপ দ্বারা উন্নত একটি প্রকল্প;. মডেল চেষ্টা করুন এবং জীবন্ত কোষ আপ করা, যা জটিল প্রক্রিয়া এবং সিস্টেম বুঝতে করার জন্য বৈশিষ্ট্য :. একটি টেক্সট ভিত্তিক মডেল বর্ণনা ভাষা কাঠামোগত বিশ্লেষণ মডিউল....

goby বাইনারি ডাটা ফাইল পড়ার জন্য একটি পাইথন এপিআই goby পরের- gen তথ্য ব্যবস্থাপনা কাঠামো ব্যবহার করে তৈরি করা হয়.সাধারণত, এই ডিরেক্টরি থেকে সম্পূর্ণ goby প্যাকেজের অংশ পাওয়া যায়, যেমন আসে:& Nbsp; http: //goby.campagnelab.org/সম্পূর্ণ প্যাকেজ জাভা...

. SSuMMo taxa ক্রম দায়িত্ব অর্পণ করা hmmer ব্যবহার করে প্রায় iteratively পরিকল্পিত ফাংশন & nbsp একটি লাইব্রেরি হয়; ফলাফল যে সম্প্রদায়ের মধ্যে প্রজাতির / মহাজাতি বিতরণ দেখাচ্ছে অত্যন্ত সটীক গাছ.সোর্স কোড সহ অন্তর্ভুক্ত প্রোগ্রাম সরঞ্জাম হল: -- গোপন...

বারোজ-হুইলার Aligner (KTM) যেমন হিউম্যান জিনোম হিসেবে একটি দীর্ঘ রেফারেন্স ক্রম বিরুদ্ধে অপেক্ষাকৃত ছোট নিউক্লিওটাইড ক্রম সাজায় যে একটি দক্ষ প্রোগ্রাম.সফটওয়্যার দুটি আলগোরিদিম, পটি-ছোট এবং বিডব্লুএ-দঃপঃ কার্যকরী. ক্যোয়ারী জন্য সাবেক কাজ 200bp তুলনায়...

পিট, আটক পূর্বাভাসের এবং প্রোটিন বায়োফিজিক্যাল বৈশিষ্ট্য বিশ্লেষণের জন্য প্রোগ্রাম একটি স্যুট.ডকুমেন্টেশন, নির্দেশাবলী, স্ক্রিনশট ইত্যাদি http://enzyme.ucd.ie/PEAT দেখুন আবশ্যক :. ...

OpenElectrophy ম্যানিপুলেশন, সঞ্চয় এবং electrophysiological তথ্য বিশ্লেষণ সহজতর একটি কাঠামো হয়. এটি বিভিন্ন ফাইল ফরম্যাটের থেকে তথ্য ইম্পোর্ট এবং একটি একক এসকিউএল-টাইপ ডাটাবেসের মধ্যে সংরক্ষণ করতে পারেন.OpenELectrophy মধ্যে অন্তর্ভুক্ত বিশ্লেষণ সরঞ্জাম...

Neo (নিউরাল আঁসাঁব্ল অবজেক্টস) এবং একসঙ্গে আরো ঘনিষ্ঠ একই লক্ষ্যের সাথে OpenElectrophy, NeuroTools এবং হয়ত অন্য প্রকল্পে পাওয়ার উদ্দেশ্য নিয়ে, নিউরাল তথ্য বিশ্লেষণ ব্যবহার করা বেস ক্লাস সাধারণ সেট প্রদান একটি প্রকল্প.দুটি প্রধান উদ্দেশ্য এ পর্যন্ত...